高效液相色譜儀依據(jù)樣品在固定相和流動相分離過程的物理化學(xué)原理，可分為以下五種。

（1）吸附色譜： 用固體吸附劑作固定相，以不同極性溶劑作流動相，依據(jù)樣品中各組分在吸附劑上吸附性能的差別來實(shí)現(xiàn)分離。

（2）分配色譜： 用載帶在固相基體上的固定液作固定相，以不同極性溶質(zhì)作流動相，依據(jù)樣品中各組分在固定液上分配性能的差別來實(shí)現(xiàn)分離。根據(jù)固定相和液體流動相相對極性的差別，又可分為正相分配色譜和反相分配色譜。當(dāng)固定相的極性大于流動相的極性時(shí)，可稱為正相分配色譜或簡稱正相色譜；若固定相的極性小于流動相的極性時(shí)，可稱為反相分配色譜或簡稱反相色譜。

（3）離子色譜：用高效微粒離子交換劑作固定相，以具有一定 pH 值的緩沖溶液作流動相，依據(jù)離子型化合物中各離子組分與離子交換劑上表面帶電荷基團(tuán)進(jìn)行可逆性離子交換能力的差別而實(shí)現(xiàn)分離。

（4）體積排阻色譜： 用化學(xué)惰性的多孔性凝膠作固定相，按固定相對樣品中各組分分子體積排阻滯作用的差別來實(shí)現(xiàn)分離 。以水溶液作流動相的體積排阻色譜柱，稱為凝膠過濾色譜；以有機(jī)溶劑作流動相的體積排阻色譜法，稱為凝膠滲透色譜法。

（5）親和色譜：以在不同基體上，鍵合多種不同特性的配位體作固定相，用具有不同 pH 值的緩沖溶液作流動相，依據(jù)生物分子與基體上鍵聯(lián)的配位體之間存在特異性親和作用能力的差別，而實(shí)現(xiàn)對具有生物活性的生物分子的分離。