狠狠色丁香久久综合婷婷亚洲成人福利在线-欧美日韩在线观看免费-国产99久久久久久免费看-国产欧美在线一区二区三区-欧美精品一区二区三区免费观看-国内精品99亚洲免费高清

            產(chǎn)品推薦:氣相|液相|光譜|質(zhì)譜|電化學(xué)|元素分析|水分測定儀|樣品前處理|試驗(yàn)機(jī)|培養(yǎng)箱


            化工儀器網(wǎng)>技術(shù)中心>專業(yè)論文>正文

            歡迎聯(lián)系我

            有什么可以幫您? 在線咨詢

            化學(xué)分析| 虛擬校正實(shí)現(xiàn)異質(zhì)性生物組織中待測物準(zhǔn)確定量質(zhì)譜成像

            來源:維科托(北京)科技有限公司   2021年03月18日 19:20  

            轉(zhuǎn)自公眾號

             

            Analytical Chemistry| 虛擬校正實(shí)現(xiàn)異質(zhì)性生物組織中待測物準(zhǔn)確定量質(zhì)譜成像

            文獻(xiàn)精讀

            再帕爾·阿不力孜科研團(tuán)隊      第39期

            中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所

            天然藥物活性物質(zhì)與功能國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

            文獻(xiàn)整理:王相宜    指導(dǎo)教師:賀玖明

            2019年1月,本課題組在Anal.Chem.上發(fā)表了一篇題為“Virtual Calibration Quantitative Mass Spectrometry Imaging for Accurately Mapping Analytes across Heterogenous Biotissue”的研究論文,采用空氣動力輔助解吸電噴霧離子化和人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法,以內(nèi)源性代謝物為天然內(nèi)標(biāo),建立了虛擬校正定量質(zhì)譜成像分析新方法,解決了生物組織中難以均勻添加內(nèi)標(biāo)化合物的技術(shù)難題,實(shí)現(xiàn)了整體動物體內(nèi)或異質(zhì)性生物組織中藥物(或內(nèi)源性代謝生物標(biāo)志物)的準(zhǔn)確定量成像分析。
             
             

            背景介紹

             
             
                    生物體各器官以及亞器官區(qū)域因其生化微環(huán)境不同使得藥物離子響應(yīng)有差異,尤其是異質(zhì)性生物組織(腎、腦、腫瘤等)的基質(zhì)效應(yīng)在組織微區(qū)中差別較大。質(zhì)譜成像(MSI)技術(shù)作為新型分子成像技術(shù),可同時獲得藥物和代謝物的類型、含量和空間分布信息,而基質(zhì)效應(yīng)限制了定量質(zhì)譜成像(QMSI)的發(fā)展。添加穩(wěn)定同位素標(biāo)記內(nèi)標(biāo)是校正基質(zhì)效應(yīng)的常用方法,但該方法成本高、樣品前處理繁瑣、內(nèi)標(biāo)化合物均勻添加困難。本研究以內(nèi)源性代謝物為天然內(nèi)標(biāo),建立了虛擬校正定量質(zhì)譜成像(VC-QMSI)分析新方法,校正每個像素點(diǎn)的相對基質(zhì)效應(yīng),實(shí)現(xiàn)準(zhǔn)確定量成像分析。
             
             

            VC-QMSI策略

             
             

            圖1 虛擬校正定量質(zhì)譜成像分析方法

            1.采用AFADESI-MSI技術(shù)實(shí)現(xiàn)生物組織中藥物和大量內(nèi)源性代謝物同時成像檢測。

            2.加入相同含量藥物至不同模擬組織中,選取與藥物離子強(qiáng)度變化相關(guān)性較高的前10個內(nèi)源性代謝物離子,作為天然內(nèi)標(biāo);以每個像素點(diǎn)中天然內(nèi)標(biāo)相對強(qiáng)度為輸入變量Xi,對應(yīng)像素中藥物相對離子強(qiáng)度為輸出變量Y,用人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法建立回歸模型fr=F(Xi)。

            3.加入系列稀釋濃度藥物至模擬組織建立標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品,輸入相應(yīng)的Xi到回歸模型fr=F(Xi)中,計算虛擬校正因子fr,并對藥物離子相對強(qiáng)度Ii進(jìn)行校正Ii′=Ii/fr,建立Ii與藥物濃度的標(biāo)準(zhǔn)曲線。

            4.檢測并計算得到的待測組織或整體動物切片中各像素點(diǎn)的校正藥物離子相對強(qiáng)度Ii,將Ii代入標(biāo)曲中得到對應(yīng)的含量,實(shí)現(xiàn)藥物準(zhǔn)確定量成像。
            5.t-SNE-Kmeans聚類分析整體動物所有像素點(diǎn),實(shí)現(xiàn)自動空間識別。
            6.完成藥物體內(nèi)分布準(zhǔn)確定量分析,進(jìn)行藥代動力學(xué)性質(zhì)評價。
             
             

            實(shí)驗(yàn)設(shè)計

             
             
            1.比較不同算法建立的回歸模型,獲得更佳算法。
            2.對高度異質(zhì)性組織微區(qū)進(jìn)行虛擬校正。
            3.用抗腫瘤藥物甲氨蝶呤MTX和其氘代物MTX-D3以及紫杉醇衍生物PTXCH驗(yàn)證VC-QMSI。
            4.用三種不同特征離子集合進(jìn)行Kmeans聚類分析,比較聚類和空間識別結(jié)果。
            5.VC-QMSI在抗腫瘤候選藥物L(fēng)XY6006(LXY)和PTXCH藥代動力學(xué)評價上的應(yīng)用。
             
             

            實(shí)驗(yàn)結(jié)果

             
             

            1.人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法準(zhǔn)確性更好

                   比較四種不同算法(主成分回歸PCR、索套回歸LR、支持向量回歸SVM、人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)ANN,圖2A)建立的回歸模型,各模擬器官相對基質(zhì)效應(yīng)的計算結(jié)果顯示,LR和ANN的擬合效果更好(圖2B),平均相對誤差約小于10%,相關(guān)系數(shù)大于0.99;用fr逐像素校正藥物離子強(qiáng)度后,各器官間平均藥物相對離子強(qiáng)度的RSD小于15%,且整體動物切片fr成像圖的區(qū)域差異明顯(圖2C)。ANN模型具有更高的準(zhǔn)確性,后續(xù)實(shí)驗(yàn)中都采用ANN回歸模型。

            圖2 不同回歸模型的基質(zhì)效應(yīng)校正因子

            2. 亞器官水平的虛擬校正

                  對高度異質(zhì)性組織(腎、腦、腫瘤)中的藥物進(jìn)行VC-QMSI,組織切片相對校正因子RCF的可視化結(jié)果(圖3A-C)和統(tǒng)計分析(圖3D-F)顯示,RCF預(yù)測值在組織亞器官區(qū)域有差異,校正后的腎髓質(zhì)和腎皮質(zhì)的標(biāo)曲線性更好且斜率更接近(圖3I),證明VC-QMSI可以校正亞器官區(qū)域的待測物離子強(qiáng)度,消除組織特異性基質(zhì)效應(yīng)的影響。

            圖3 高度異質(zhì)性組織亞器官水平RCF預(yù)測

            3. VC-QMSI驗(yàn)證

                   加入相同含量MTX和MTX-D3至不同模擬組織中,虛擬校正后各組織間和像素間的MTX離子強(qiáng)度差異RSD均下降;加入系列稀釋濃度MTX和MTX-D3至不同模型樣本(S1-S6)中,結(jié)果表明虛擬校正(VC)和同位素校正(IC)的標(biāo)曲線性一致,r=0.9994(圖4B-C)。使用VC-QMSI方法,終得到MTX(圖5B)和其代謝產(chǎn)物(圖5C)在整體動物切片中的定量成像圖。以上結(jié)果說明VC具有與IC相同的效果。以PTXCH為待測物,加入系列濃度標(biāo)準(zhǔn)溶液至不同模擬組織中,虛擬校正后的標(biāo)曲線性更好,并且成功用于肌肉和腫瘤組織的校正和定量(圖6)。

            圖4 MTX標(biāo)準(zhǔn)曲線(A:未校正)

            圖5 MTX和其代謝產(chǎn)物7-羥基-MTX整體動物定量質(zhì)譜成像結(jié)果(A:RCF成像)

            圖6 添加PTXCH組織的線性擬合和外推結(jié)果

            4.t-SNE-Kmeans聚類分析空間識別準(zhǔn)確

                    本研究建立了無監(jiān)督的、基于代謝組學(xué)特征的區(qū)域聚類模型,實(shí)現(xiàn)更準(zhǔn)確的自動空間識別。分別使用110個內(nèi)源性代謝物離子、3個PCA成分和3個t-SNE成分作為輸入變量,三者Kmeans聚類分析結(jié)果顯示,t-SNE-Kmeans聚類分析方法將整體動物切片所有像素分為14個集群,且集群重疊少(圖7A)。將像素按照位置索引重構(gòu)整體動物圖像(圖7D),發(fā)現(xiàn)絕大部分同一組織學(xué)區(qū)域的像素點(diǎn)屬于同一集群。該方法可以提高定量藥物分布的準(zhǔn)確性,避免基于光學(xué)圖像指導(dǎo)的人工組織區(qū)域選擇造成的誤差。

            圖7 比較不同方法的像素聚類和空間分割結(jié)果

            5.藥代動力學(xué)性質(zhì)評價

                   LXY在整體動物上的定量分布如圖8所示,模擬心和肺中藥物響應(yīng)較低,而在校正后離子化效率和其他器官達(dá)到同一水平。將VC-QMSI和TEC(組織消光系數(shù))-QMSI的定量結(jié)果進(jìn)行比較,相對誤差≤±35%,兩者呈線性相關(guān)r=0.9855,說明VC-QMSI可以提供藥物準(zhǔn)確定量分布情況,并且可用于未知組織的定量分析。    

                   VC-QMSI也可應(yīng)用于臨床前藥物研究,例如定量計算LXY不同劑型和給藥方式的生物利用度。此外,我們通過可視化藥物在整體動物切片中的分布情況,直觀比較抗腫瘤候選藥物L(fēng)XY和PTXCH以及陽性藥PTX的腫瘤靶向效率(圖9),推測PTXCH有更好的靶向治療效果和更低的不良反應(yīng)。

            圖8 LXY定量質(zhì)譜成像結(jié)果

            圖9 整體動物中不同抗腫瘤藥物的時空變化

             
             

            總結(jié)

             
             
                   VC-QMSI采用AFADESI-MSI技術(shù)和人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法,以內(nèi)源性代謝物為天然內(nèi)標(biāo),建立待測物濃度與內(nèi)源性代謝物之間的相對基質(zhì)效應(yīng)預(yù)測回歸模型,實(shí)現(xiàn)每個像素點(diǎn)的基質(zhì)效應(yīng)校正,從而達(dá)到準(zhǔn)確定量質(zhì)譜成像分析。該方法解決了生物組織中難以均勻添加內(nèi)標(biāo)化合物的難題,無需高成本的同位素內(nèi)標(biāo)制備和繁瑣的樣品前處理,且實(shí)現(xiàn)了整體動物或異質(zhì)性組織微區(qū)中藥物或生物標(biāo)志物的準(zhǔn)確定量成像分析,為新藥研發(fā)或疾病診斷提供了更加準(zhǔn)確可靠的可視化研究工具。
            參考文獻(xiàn):Song X,He J,Pang X,et al.Virtual Calibration Quantitative Mass Spectrometry Imaging for Accurately Mapping Analytes Across Heterogenous Bio-tissue[J]. Analytical chemistry, 2019,91(4):2838-2846

            免責(zé)聲明

            • 凡本網(wǎng)注明“來源:化工儀器網(wǎng)”的所有作品,均為浙江興旺寶明通網(wǎng)絡(luò)有限公司-化工儀器網(wǎng)合法擁有版權(quán)或有權(quán)使用的作品,未經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)不得轉(zhuǎn)載、摘編或利用其它方式使用上述作品。已經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)使用作品的,應(yīng)在授權(quán)范圍內(nèi)使用,并注明“來源:化工儀器網(wǎng)”。違反上述聲明者,本網(wǎng)將追究其相關(guān)法律責(zé)任。
            • 本網(wǎng)轉(zhuǎn)載并注明自其他來源(非化工儀器網(wǎng))的作品,目的在于傳遞更多信息,并不代表本網(wǎng)贊同其觀點(diǎn)和對其真實(shí)性負(fù)責(zé),不承擔(dān)此類作品侵權(quán)行為的直接責(zé)任及連帶責(zé)任。其他媒體、網(wǎng)站或個人從本網(wǎng)轉(zhuǎn)載時,必須保留本網(wǎng)注明的作品第一來源,并自負(fù)版權(quán)等法律責(zé)任。
            • 如涉及作品內(nèi)容、版權(quán)等問題,請在作品發(fā)表之日起一周內(nèi)與本網(wǎng)聯(lián)系,否則視為放棄相關(guān)權(quán)利。
            企業(yè)未開通此功能
            詳詢客服 : 0571-87858618