藥物在生產加工、包裝運輸?shù)冗^程中易引入少量雜質。由于工藝改進及產品質控等需要對雜質進行定性定量分析，但往往由于含量低且化合物未知，需要一種靈敏度高且能夠對未知化合物進行定性分析的分析手段。GC/MS能夠滿足這種需求，既能夠采用NIST譜庫對未知化合物進行定性分析、結構鑒定，又能夠對藥物中痕量雜質進行定量分析。本方法以GC-MS檢測口服液中的苯甲酰芽zi堿為例進行說明。
樣品前處理：口服液樣品采用固相萃取的方法進行萃取濃縮，SPE小柱為Trace-B，具體操作步驟見圖4-18。萃取完后采用六氟異丙醇（HFIP）和（PFPA）進行衍生化，氮氣吹干后，乙酸乙酯復溶，GC/MS分析。
GC/MS分析條件圖4-18 口服液樣品前處理過程色譜條件：色譜柱：TR-5MS, 15 m×0.25 mm×0.25 µm， P/N：260F130P；柱溫：110℃（1 min），30℃/min到240℃（0.1 min），120℃/min到300℃（0.2 min）。進樣口溫度：220℃；不分流進樣，分流時間為1 min；進樣量：2 µL。載氣：氦氣（99.999%），載氣模式：1.5 mL/min（5 min），以7 mL/min升至5 mL/min（0.6 min）。質譜條件：Full scan模式：離子源溫度：200℃，掃描范圍：50-650 amu。SIM模式：離子源溫度：225℃；選擇離子為：318.10,321.10, 438.90, 442.10。PCI SIM模式：離子源溫度：200℃，選擇離子為：318.10, 321.10, 440.10, 443.20。
分析結果本實驗中比較了兩種不同離子源的靈敏度。實驗結果表明采用PCI分析苯甲酰芽zi堿得到的靈敏度更高（見圖4-19），且無雜質干擾。
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