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近些年來,蛋白質(zhì)組學研究是生物領(lǐng)域比較熱門和研究廣泛的方向。而Western Blot實驗是研究蛋白組學的基本實驗操作。但是一個成功的Western Blot實驗結(jié)果需要注意很多細節(jié)。
Western Blot即蛋白質(zhì)免疫印跡實驗,利用抗原抗體特異性結(jié)合來檢測目的蛋白的表達量。蛋白質(zhì)印跡法是由瑞士*弗雷德里希生物研究所(Friedrich Miescher Institute)的Harry Towbin在1979年提出的。在尼爾·伯奈特(Neal Burnette)于1981年所著的《分析生物化學》(Analytical Biochemistry)中第一次被稱為Western Blot。蛋白免疫印跡(Western Blot)是將電泳分離后的細胞或組織中的蛋白質(zhì)從凝膠轉(zhuǎn)移到固相支持物NC膜或PVDF膜上,然后用特異性抗體檢測某特定抗原的一種蛋白質(zhì)檢測技術(shù),現(xiàn)已廣泛應用于基因在蛋白水平的表達研究、抗體活性檢測和疾病早期診斷等多個方面。
下面詳細介紹每一步的操作:
一、樣品的制備
樣本來源一般分為細胞和組織,常用的裂解液為RIPA(強)裂解液,需要加入適量的蛋白酶抑制劑。根據(jù)所收集的細胞沉淀多少或組織塊大小,加入適量的裂解液。根據(jù)說明書,冰上裂解10min或30min,定時進行渦旋震蕩。用BCA試劑盒進行蛋白定量,加入Loading Buffer于99℃的金屬浴上煮樣10min。
*加入的Loading Buffer目的
主要成分 | 主要功能 |
SDS | 使蛋白質(zhì)變性并帶上負電荷 |
甘油 | 增加樣品密度,使樣品沉降 |
溴酚藍 | 離子型染料,可觀察蛋白的遷移 |
DTT | 減少二硫鍵的形成 |
二、凝膠電泳
* SDS凝膠配置原則:
先配置分離膠,再配置濃縮膠;
分子量越高,分離膠濃度越低;
根據(jù)上樣量選擇對應的玻璃板和梳子。
配膠成分表:
分離膠15% | 分離膠12% | 分離膠10% | 分離膠8% | 濃縮膠5% | |
總體積 | 10ml | 10ml | 10ml | 10ml | 5ml |
30%丙烯酰胺(29:1) | 5ml | 4ml | 3.3ml | 2.7ml | 0.83ml |
4XSDS-PAGE濃縮膠 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1.25ml |
4XSDS-PAGE分離膠 | 2.5ml | 2.5ml | 2.5ml | 2.5ml | 0 |
10%過硫酸銨 | 40ul | 40ul | 40ul | 40ul | 30ul |
TEMED | 4ul | 4ul | 4ul | 4ul | 3ul |
ddH2O | 2.4ml | 3.4ml | 4.1ml | 4.7ml | 2.84ml |
最佳分離范圍 | 10-40KD | 12-60KD | 20-80KD | 30-90KD | —— |
配膠注意事項:
(1)清洗玻璃板:可以先用海綿擦清洗玻璃板,在用去離子水潤洗一次,可以放置于烘箱或通風廚中晾干。
(2)按照配膠表進行配置,充分混勻后在玻璃板中灌膠。
(3)加水或者醇類液封,速度要慢,防止將分離膠沖不勻或變形。
* 電泳
采用SDS-PAGE電泳,每孔上樣量可為20-50ng。在適當空內(nèi)加入marker。先用80V電壓使樣品進行充分濃縮,到達分離膠后調(diào)為120V,當溴酚藍要跑出即可終止電泳,進行轉(zhuǎn)膜。
* 轉(zhuǎn)膜
一般分為PVDF膜和NC膜,PVDF膜價格較貴,結(jié)合能力較強;NC膜價格便宜,結(jié)合能力較PVDF膜差,不能重復使用。
PVDF膜是疏水性的,膜孔徑有大有小,隨著膜孔徑的不斷減小,膜對低分子量的蛋白結(jié)合就越牢固。大于20 kDa的蛋白選用0.45 um的膜,小于20 kDa的蛋白選用0.2 um的膜。PVDF膜在使用時需預處理,用甲醇激活15s,目的是活化膜上的正電基團,使其更容易與帶負電的蛋白結(jié)合(注意:不要有氣泡!不要將膠放干!原理:電場力作用條件下,PAGE膠中的帶負電荷的蛋白會發(fā)生定向遷移)。轉(zhuǎn)膜過程會產(chǎn)熱導致蛋白質(zhì)降解,因此要使用冰袋散熱。目前市面上的快速轉(zhuǎn)膜液可以在常溫下400mA轉(zhuǎn)30min完成,方便快捷。
注意事項:
如果紙、膜比凝膠大就比較容易形成短路了,上下兩層慮紙也不能因過大而相互接觸,這樣同樣會短路,電流不會通過膠和慮紙。轉(zhuǎn)移前和轉(zhuǎn)移過程中看看電壓就行,正常的半干是慢慢變高的,最后結(jié)束時一般是開始的 1.5-3 倍都是正常的。一般 Buffer 和濾紙選的對就不會短路。
轉(zhuǎn)膜方法:濕轉(zhuǎn)
轉(zhuǎn)膜后可以用麗春紅對膜進行染色,檢驗轉(zhuǎn)膜效率。
* 封閉
一般用5%的脫脂奶粉或者5%的BSA進行封閉。對于磷酸化或者生物素標記的抗體只能用5%的BSA。封閉是假為室溫1-2h。目的是去除非特異性結(jié)合。
* 一抗孵育
封閉后用TBST潤洗一次,然后根據(jù)蛋白的分子量大小進行裁膜,將對應的膜放入用一抗稀釋液配好的抗體中(具體稀釋比例要根據(jù)抗體說明書進行)。在4℃條件下置于搖床上孵育過夜。
* 洗膜
一抗孵育結(jié)束后,回收一抗,用TBST洗膜,每次7min,洗3次。
* 二抗孵育
洗膜結(jié)束后,加入配好的二抗(對應好一抗的種屬來源),室溫下置于搖床上1h,然后回收二抗,再次洗膜。
* 顯影
將PVDF膜洗干凈后,滴加ECL發(fā)光液,孵育1min左右,可進行顯影。
Western Blot可能遇到的問題:
無顯色信號問題的原因分析:
1.裂解產(chǎn)物中抗原含量不足;
a. 抗原無表達或表達量過少
b. 蛋白降解或上樣量不足
c. 裂解產(chǎn)物制備失誤
2.制膠濃度比例不合適;
3.轉(zhuǎn)膜不*;
4.一抗稀釋濃度過大;
5.二抗與一抗不匹配;
6.顯色系統(tǒng)靈敏度不足
非特意性雜帶出現(xiàn)的原因分析:
1.封閉或清洗不*;
2.一抗?jié)舛冗^高;
3.蛋白降解;
4.抗體與非特異性蛋白交叉反應;
5.蛋白間聚集作用,形成二聚體;
6.轉(zhuǎn)移膜使用不當;
7.操作過程中轉(zhuǎn)移膜干燥
有一些污點的原因分析:
1.轉(zhuǎn)膜有氣泡;
2.孵育不均勻;
3.脫脂奶粉沒有充分溶解
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