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            基因的編輯調(diào)控技術(shù)—轉(zhuǎn)染,您了解多少?

            閱讀:1682      發(fā)布時間:2022-12-6
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            轉(zhuǎn)染——是將外源基因如DNA、RNA導(dǎo)入真核細(xì)胞的技術(shù)。是真核細(xì)胞在一定條件下主動或被動導(dǎo)入外源基因而獲得新的表型的過程。隨著分子生物學(xué)和細(xì)胞生物學(xué)研究的不斷發(fā)展,轉(zhuǎn)染已經(jīng)成為研究和控制真核細(xì)胞基因功能的常規(guī)工具。在研究基因功能、基因表達調(diào)控、突變分析和蛋白質(zhì)生產(chǎn)等領(lǐng)域中,轉(zhuǎn)染技術(shù)的應(yīng)用越來越廣泛。

            圖1 轉(zhuǎn)染

             

            轉(zhuǎn)染的分類

            根據(jù)外源性基因在真核細(xì)胞中表達時間的長短我們可將轉(zhuǎn)染技術(shù)可分為瞬時轉(zhuǎn)染和穩(wěn)定轉(zhuǎn)染兩種。在瞬時轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中,外源基因得以表達但它們并不會整合到細(xì)胞的基因組中,也就不會被復(fù)制,適用的核酸類型主要包括質(zhì)粒DNA、siRNA、miRNA和mRNA。細(xì)胞瞬時轉(zhuǎn)染的外源基因表達時間有限,通常僅持續(xù)幾天,直到外源基因在細(xì)胞分裂過程中因各種因素丟失為止。穩(wěn)定轉(zhuǎn)染是建立在瞬時轉(zhuǎn)染的基礎(chǔ)上的,先對細(xì)胞進行轉(zhuǎn)染,再對得到的細(xì)胞進行篩選,在少數(shù)轉(zhuǎn)染細(xì)胞中,外源基因能夠整合到細(xì)胞的基因組中。適用的核酸類型只有質(zhì)粒DNA,且外源基因成為細(xì)胞基因組的一部分從而得以復(fù)制,這就是穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細(xì)胞的標(biāo)志。穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細(xì)胞的子代細(xì)胞也同樣表達外源基因,由此形成穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的細(xì)胞系。

            圖2 瞬時轉(zhuǎn)染和穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的區(qū)別

            常規(guī)細(xì)胞轉(zhuǎn)染的途徑

            1化學(xué)介導(dǎo)法

            主要是使用載體分子去中和或者使帶負(fù)電的核酸帶正電荷,讓核酸更容易進入細(xì)胞內(nèi)。主要包括DEAE-葡聚糖法、磷酸鈣法、陽離子脂質(zhì)體法、陽離子聚合物法等。

            化學(xué)介導(dǎo)法

            原理

            主要應(yīng)用

            特點

            DEAE-葡聚糖法

            帶正電的DEAE-葡聚糖與核酸帶負(fù)電的磷酸骨架相互作用形成的復(fù)合物被細(xì)胞內(nèi)吞

            瞬時轉(zhuǎn)染

            相對簡便、重復(fù)比磷酸鈣好,但對細(xì)胞有一定的毒副作用,轉(zhuǎn)染時需除血清且一般只用于BSC-1、CV-1、COS細(xì)胞系

            磷酸鈣法

            磷酸鈣DNA復(fù)合物吸附細(xì)胞膜被細(xì)胞內(nèi)吞

            穩(wěn)定轉(zhuǎn)染、瞬時轉(zhuǎn)染

            不適用于原代細(xì)胞(所需的DNA濃度較高),操作簡便但重復(fù)性差,有些細(xì)胞不適用。細(xì)胞建議用CSCL梯度離心,轉(zhuǎn)染時拷貝數(shù)較多

            人工脂質(zhì)體法

            帶正電的脂質(zhì)體與核酸帶負(fù)電的磷酸基團形成復(fù)合物,然后脂質(zhì)體上剩余的電核與細(xì)胞膜上的唾液酸殘基的負(fù)電核結(jié)合

            穩(wěn)定轉(zhuǎn)染、瞬時轉(zhuǎn)染

            使用方法簡單,可攜帶大片段DNA,通用于各種類型的裸露DNA或RNA,能轉(zhuǎn)染各種類型的細(xì)胞,沒有免疫原性。雖在體外基因轉(zhuǎn)染中有很高的效率,但在體內(nèi),能被血清清除,并在肺組織內(nèi)累積,誘發(fā)強烈的抗炎反應(yīng),導(dǎo)致高水平的毒性,這在很大程度上限制了其應(yīng)用

            陽離子聚合物

            帶正電的聚合物與核酸帶負(fù)電的磷酸基團形成帶正電的復(fù)合物后與細(xì)胞表面帶負(fù)電的蛋白多糖相互作用,并通過內(nèi)吞作用進入細(xì)胞

            穩(wěn)定轉(zhuǎn)染、瞬時轉(zhuǎn)染所有細(xì)胞

            除了具有陽離子脂質(zhì)體的轉(zhuǎn)染效率高、操作簡單、適用范圍廣、重復(fù)性好等特點外,還具有在體內(nèi)、轉(zhuǎn)染效率高、細(xì)胞毒性低等特點,是新一代的轉(zhuǎn)染方法


            2物理介導(dǎo)法

            物理介導(dǎo)法是將核酸直接遞送到細(xì)胞質(zhì)或細(xì)胞核中。主要包括電轉(zhuǎn)染、顯微注射法、基因槍法。

            物理介導(dǎo)法

            原理

            主要應(yīng)用

            特點

            電轉(zhuǎn)染

            通過高脈沖電壓破壞細(xì)胞膜電,DNA通過膜上形成的小孔導(dǎo)入細(xì)胞內(nèi)

            穩(wěn)定轉(zhuǎn)染、瞬時轉(zhuǎn)染所有細(xì)胞

            適用性廣,除了質(zhì)粒外還可轉(zhuǎn)染大的基因組(>65kb),但細(xì)胞致死率高,DNA和細(xì)胞用量大, 需根據(jù)不同細(xì)胞類型優(yōu)化電穿孔實驗條件,拷貝數(shù)較少只有1-20

            顯微注射法

            用顯微操作將DNA直接注入靶細(xì)胞核

            穩(wěn)定轉(zhuǎn)染、瞬時轉(zhuǎn)染

            轉(zhuǎn)染細(xì)胞數(shù)有限,多用于工程改造或轉(zhuǎn)基因動物的胚胎細(xì)胞

            基因槍法

            將DNA用顯微重金屬顆粒沉淀,再將包被好的顆粒用彈道裝置投射入細(xì)胞,DNA在胞內(nèi)逐步釋放、表達

            穩(wěn)定轉(zhuǎn)染、瞬時轉(zhuǎn)染

            可用于的細(xì)胞類型有:人的表皮細(xì)胞,纖維原細(xì)胞,淋巴細(xì)胞系以及原代細(xì)胞


            3生物介導(dǎo)法

            又稱之為病毒介導(dǎo)法,是利用包裝了外源基因的病毒感染細(xì)胞的方法使得其進入細(xì)胞。病毒介導(dǎo)法轉(zhuǎn)染效率很高,尤其是針對難轉(zhuǎn)染的活體細(xì)胞、原代細(xì)胞。主要包括慢病毒、逆轉(zhuǎn)錄病毒、腺病毒等病毒介導(dǎo)法。

            生物介導(dǎo)法

            病毒基因

            原理

            主要應(yīng)用

            特點

            慢病毒

            RNA病毒

            包裝系統(tǒng)由包裝成分和載體成分組成。將包裝成分與載體成分的多個質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染包裝細(xì)胞,即可在細(xì)胞上清中收獲攜帶目的基因的復(fù)制的慢病毒載體顆粒。包裝好的病毒顆??梢灾苯佑糜谒拗骷?xì)胞的感染,目的基因進入到宿主細(xì)胞之后,經(jīng)過反轉(zhuǎn)錄,整合到基因組,從而高水平的表達效應(yīng)分子

            穩(wěn)定轉(zhuǎn)染特定宿主細(xì)胞

            可以感染分裂期和非分裂期細(xì)胞、容納外源性基因片段大,可以長期表達等顯著優(yōu)點。

            逆轉(zhuǎn)錄病毒

            RNA病毒

            通過病毒中膜糖蛋白和宿主細(xì)胞表面的受體相互作用而進入宿主細(xì)胞,之后反轉(zhuǎn)錄酶啟動合成DNA并隨機整合到宿主基因組中

            穩(wěn)定轉(zhuǎn)染特定宿主細(xì)胞

            可用于難轉(zhuǎn)染的細(xì)胞、原代細(xì)胞,體內(nèi)細(xì)胞等,但攜帶基因不能太大(<8kb),細(xì)胞需處分裂期,需考慮安全因素

            腺病毒

            雙鏈DNA病毒

            先和細(xì)胞表面的受體結(jié)合,繼而被細(xì)胞內(nèi)吞

            瞬時轉(zhuǎn)染特定宿主細(xì)胞

            可用于感染分裂期和非分裂期細(xì)胞、難轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,需考慮安全因素



            圖6 細(xì)胞轉(zhuǎn)染的途徑

            細(xì)胞轉(zhuǎn)染相關(guān)實驗

            圖7 細(xì)胞轉(zhuǎn)染流程圖

            以質(zhì)粒DNA為例介紹細(xì)胞轉(zhuǎn)染的流程(24孔板、貼壁細(xì)胞、核酸轉(zhuǎn)染試劑盒(貨號:abs60259)):

            實驗材料

            1.1儀器設(shè)備

            CO2培養(yǎng)箱、超凈工作臺、倒置顯微鏡、臺式冷凍離心機、水浴鍋、醫(yī)用冰箱、-80℃冰箱、移液器(一套)、細(xì)胞計數(shù)儀等。

            1.2試劑耗材
            DMEM培養(yǎng)基、胎牛血清(FBS)、磷酸緩沖溶液(PBS)、胰酶、核酸轉(zhuǎn)染試劑盒(abs60259)、24孔板、1.5ml無菌離心管若干等。

            實驗步驟

            Step1 細(xì)胞接種:

            1.轉(zhuǎn)染前一天對細(xì)胞進行轉(zhuǎn)接,每孔接種1.5-2.0×105個細(xì)胞,使轉(zhuǎn)染時細(xì)胞密度為90%左右,且生長良好(非常重要);

            2.最好在轉(zhuǎn)染開始之前更換新鮮的含血清培養(yǎng)基,以防轉(zhuǎn)染后孵育階段細(xì)胞密度太大、營養(yǎng)不足導(dǎo)致細(xì)胞死亡。

            Step2 試劑A/DNA轉(zhuǎn)染復(fù)合物制備(該步完成后應(yīng)立即進行轉(zhuǎn)染):

            1.在1.5 ml無菌離心管A中加入50µl無血清培養(yǎng)基,再加入適量的轉(zhuǎn)染試劑A,見下表8。用移液器輕輕混勻后在室溫靜置5分鐘。

            2.在1.5 ml無菌離心管B中加入50µl無血清培養(yǎng)基,并加入適量的試劑B,輕輕混勻,再加入適量的DNA,見下表8。用移液器再次輕輕混勻后在室溫靜置5分鐘。

            3.將DNA-培養(yǎng)基混合物滴加至試劑A-培養(yǎng)基混合物中,用移液器輕輕混勻后在室溫靜置15~20分鐘后,立即轉(zhuǎn)染。

            注意: 1. 試劑A-培養(yǎng)基混合物和DNA-培養(yǎng)基混合物的混合次序非常重要,切勿顛倒。

              2. 離心管最好使用聚丙烯離心管。

            Step3 轉(zhuǎn)染:

            1.將Step2制備的轉(zhuǎn)染復(fù)合物滴加至培養(yǎng)基中,邊加邊輕輕晃動培養(yǎng)板以使復(fù)合物均勻分布。加完后,立即將培養(yǎng)板轉(zhuǎn)入培養(yǎng)箱繼續(xù)培養(yǎng)。

            2.培養(yǎng)12小時后即可觀察,最佳觀察或收獲時間為24~48小時。

            3.試劑A在培養(yǎng)基中仍有較高的轉(zhuǎn)染效率,因此轉(zhuǎn)染前后不需要換成無血清或低血清培養(yǎng)基。

            培養(yǎng)皿

            96孔板

            48孔板

            24孔板

            12孔板

            6孔板

            10cm皿

            培養(yǎng)基、試劑、DNA量

            無血清培養(yǎng)基(μl)

            2x10

            2x25

            2x50

            2x100

            2x200

            2x1000


            試劑A(μl)

            0.5

            1.3

            2.5

            5

            10

            50


            試劑B(μl)

            0.4

            1

            2

            4

            8

            40


            1ug/ul plasmid(μl)

            0.16

            0.4

            0.8

            1.6

            3.2

            16

            培養(yǎng)基

            0.1

            0.25

            0.5

            1

            2

            10

            表8 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染不同培養(yǎng)體系推薦初始轉(zhuǎn)染條件

            影響細(xì)胞轉(zhuǎn)染效果的因素
            (1) 細(xì)胞密度

            細(xì)胞密度對轉(zhuǎn)染效率有一定的影響。不同的轉(zhuǎn)染試劑,要求轉(zhuǎn)染時的最適細(xì)胞密度各不相同,即使同一種試劑,也會因不同的細(xì)胞類型或應(yīng)用而異。轉(zhuǎn)染時過高或者過低的細(xì)胞密度會導(dǎo)致轉(zhuǎn)染效率降低,乃至表達水平偏低。因此如果選用新的細(xì)胞系或者新的轉(zhuǎn)染試劑,最好能夠進行優(yōu)化實驗并為以后的實驗建立一個穩(wěn)定方法,包括適當(dāng)?shù)慕臃N量和培養(yǎng)時間等。陽離子脂質(zhì)體試劑具有微量的細(xì)胞毒性而往往需要更高的鋪板密度或者更多的懸浮細(xì)胞數(shù),有的要求細(xì)胞達到90%匯合度;而研究細(xì)胞周期等表達周期長的基因,就需要較低的鋪板密度,所以需要選擇能夠在較低鋪板密度下進行轉(zhuǎn)染的試劑。一般轉(zhuǎn)染時貼壁細(xì)胞密度大致為50%-90%,但這個需要參考所選轉(zhuǎn)染試劑的說明書。

            (2) 細(xì)胞生長狀態(tài)

            這點非常關(guān)鍵,很多時候傳代次數(shù)太少或者太多都將導(dǎo)致細(xì)胞對轉(zhuǎn)染試劑敏感度的改變。因此,為了提高轉(zhuǎn)染效率以及轉(zhuǎn)染穩(wěn)定性、降低細(xì)胞毒性,應(yīng)盡量使用適度傳代、生長狀態(tài)良好的細(xì)胞系。轉(zhuǎn)染的細(xì)胞是經(jīng)過幾次傳代后達到指數(shù)生長期的細(xì)胞,細(xì)胞生長旺盛,最容易轉(zhuǎn)染。

            (3) 細(xì)胞種類、轉(zhuǎn)染試劑、轉(zhuǎn)染方法

            不同細(xì)胞種類的細(xì)胞在做轉(zhuǎn)染時轉(zhuǎn)染效率通常不同,因此所需要的轉(zhuǎn)染體系是不同的,不能一種轉(zhuǎn)染體系用在所有類型細(xì)胞的轉(zhuǎn)染實驗。實驗前應(yīng)根據(jù)實驗要求和細(xì)胞特性選擇適合的轉(zhuǎn)染試劑。每種轉(zhuǎn)染試劑都有不同的轉(zhuǎn)染方法,但大都大同小異,同時目前產(chǎn)品都會提供一些已經(jīng)成功轉(zhuǎn)染的細(xì)胞株列表和文獻,通過這些資料可選擇實驗設(shè)計的轉(zhuǎn)染試劑。另外,在大規(guī)模使用前,仍需進行轉(zhuǎn)染試劑和核酸比例的實踐摸索。

            (4) 核酸類型及質(zhì)量

            用于轉(zhuǎn)染的核酸類型一般有質(zhì)粒DNA、mRNA 、sirNA和miRNA,針對不同的核酸一般采用不同的轉(zhuǎn)染試劑和轉(zhuǎn)染方法。另外在制備高純度DNA時,還需要對DNA進行內(nèi)毒素的去除,內(nèi)毒素的存在會造成細(xì)胞毒性,嚴(yán)重影響轉(zhuǎn)染效率。同時DNA質(zhì)量對轉(zhuǎn)染的效果影響也非常大,一般轉(zhuǎn)染技術(shù)是基于電荷吸引原理,如果DNA不純,帶有污染物都會顯著影響轉(zhuǎn)染復(fù)合物的的形成。


            圖9 細(xì)胞轉(zhuǎn)染圖

            本期小愛推薦

            轉(zhuǎn)染類產(chǎn)品推薦

            貨號

            產(chǎn)品名稱

            規(guī)格

            abs60259

            核酸轉(zhuǎn)染試劑盒

            0.5ml/1.0ml/1.5ml

            abs60255

            質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)染試劑盒(貼壁細(xì)胞)

            0.5ml/1.0ml/1.5ml

            abs60256

            PM原代細(xì)胞質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)染試劑盒

            0.5ml/1.0ml/1.5ml

            abs60257

            溶液A(轉(zhuǎn)染增強劑,僅用于質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)染)

            0.25ml/0.5ml/1ml

            abs60317

            核酸共轉(zhuǎn)染試劑

            0.5ml/1.0ml/1.5ml

            abs60322

            Lipofect5000質(zhì)粒轉(zhuǎn)染試劑

            0.5ml/1.0ml

            abs60324

            PM原代細(xì)胞核酸轉(zhuǎn)染試劑盒

            0.5ml/1.0ml/1.5ml

            abs60325

            SP懸浮細(xì)胞核酸轉(zhuǎn)染試劑盒

            0.5ml/1.0ml/1.5ml

            abs60327

            SP懸浮細(xì)胞質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)染試劑盒

            0.5ml/1.0ml/1.5ml


            細(xì)胞培養(yǎng)類產(chǎn)品推薦

            貨號

            品名

            規(guī)格

            abs47047834

            胰酶

            100g/500g

            abs961

            10×PBS緩沖液

            500ml/500ml×10

            abs9468

            RPMI 1640 培養(yǎng)基(ATCC 改良)

            500ml

            abs9484

            RPMI-1640培養(yǎng)基

            500ml/500ml×10

            abs9483

            高糖 DMEM 培養(yǎng)基(含 L-谷氨酰胺和丙酮酸鈉)

            500ml/500ml×10

            abs9501

            無糖 DMEM 培養(yǎng)基(不含HEPES、L-谷氨酰胺和丙酮酸鈉,含酚紅)

            500ml/500ml×10

            abs972

            胎牛血清(優(yōu)級)

            125ml/500ml

            abs973

            胎牛血清(優(yōu)級),輻照

            125ml/500ml

            abs974

            胎牛血清(標(biāo)準(zhǔn)級)

            125ml/500ml

            abs975

            胎牛血清(標(biāo)準(zhǔn)級),輻照

            125ml/500ml

            abs7004

            細(xì)胞培養(yǎng)皿(35mm)

            500個/箱

            abs7005

            細(xì)胞培養(yǎng)皿(60mm)

            500個/箱

            abs7003

            細(xì)胞培養(yǎng)皿(100mm)

            500個/箱

            abs7033

            標(biāo)準(zhǔn)透明6孔細(xì)胞培養(yǎng)板

            50個/盒

            abs7034

            標(biāo)準(zhǔn)透明12孔細(xì)胞培養(yǎng)板

            50個/箱

            abs7035

            標(biāo)準(zhǔn)透明24孔細(xì)胞培養(yǎng)板

            50個/盒

            abs7040

            標(biāo)準(zhǔn)透明48孔細(xì)胞培養(yǎng)板

            50個/箱

            abs7036

            標(biāo)準(zhǔn)透明96孔細(xì)胞培養(yǎng)板

            50個/盒

            abs7119

            1.5ml離心管(無菌無酶)

            500支/盒,10盒/箱(1袋/盒)

             


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