冷凍速率是指降溫的速度，直接關(guān)系到冷凍效果。細(xì)胞在冷凍過程中會發(fā)生如下變化：當(dāng)細(xì)胞被冷至-5℃時，因溶液中加有冷凍保護(hù)劑而降低溶液的冰點(diǎn)，細(xì)胞內(nèi)外溶液仍未結(jié)冰；當(dāng)被冷至-5～-15℃之間時，細(xì)胞外溶液先出現(xiàn)結(jié)冰而細(xì)胞內(nèi)仍保持未結(jié)冰狀態(tài)。細(xì)胞內(nèi)未結(jié)冰的水分子會比細(xì)胞外部分結(jié)冰溶液中的水分子具有更高的化學(xué)能。其結(jié)果是，細(xì)胞內(nèi)水分子為了和細(xì)胞外水分子保持化學(xué)能的平衡，會向細(xì)胞外流動。冷凍速度不同，細(xì)胞內(nèi)水分向外流動的情況也不相同：如果冷凍速度慢，細(xì)胞內(nèi)水分外滲多，細(xì)胞脫水，體積縮小，細(xì)胞內(nèi)溶質(zhì)濃度增高，細(xì)胞內(nèi)不會發(fā)生結(jié)冰；如果冷凍速度快，細(xì)胞內(nèi)水分沒有足夠的時間外滲，結(jié)果隨著溫度的下降而發(fā)生細(xì)胞內(nèi)結(jié)冰；如果冷凍速度非?？欤闯焖倮鋬觯?，則細(xì)胞內(nèi)形成的冰晶非常小或不結(jié)冰而呈玻璃狀態(tài)（玻璃化冷凍）。Luyet（1973）證實液體的凝固可分為兩種形式：一種是晶體化，溶液中的分子呈有序排列；另一種情況是非晶體即玻璃化，液體中的分子呈無序狀態(tài)，保持未凝固前的狀態(tài)。

不同的冷凍速度既然能使細(xì)胞內(nèi)發(fā)生不同的生理變化，也可以對細(xì)胞產(chǎn)生不同的損傷。當(dāng)冷凍速度過慢時，細(xì)胞脫水嚴(yán)重，細(xì)胞體積嚴(yán)重收縮，超過一定程度時即失去活性。同時冷凍速度過慢，還會引起細(xì)胞外溶液部分結(jié)冰，從而使細(xì)胞外未結(jié)冰的溶液中溶質(zhì)濃度增高，產(chǎn)生溶質(zhì)損傷。當(dāng)冷凍速度過快時，細(xì)胞內(nèi)水分來不及外滲，會形成較到冰晶，造成細(xì)胞膜及細(xì)胞器的破壞，產(chǎn)生細(xì)胞內(nèi)冰晶損傷。超快速玻璃化冷凍對細(xì)胞存活來說是zui為理想的冷凍方法。細(xì)胞內(nèi)外呈玻璃化凝固，無冰晶形成或形成很小的冰晶，對細(xì)胞膜和細(xì)胞器不致造成損傷，細(xì)胞也不會在高濃度的溶質(zhì)中長時間暴露而受損。 
不同細(xì)胞的zui適冷凍速率不同。小鼠骨髓干細(xì)胞、酵母、人紅細(xì)胞的zui適冷凍速率分別為1.6℃/min、7℃/min和200℃/min。細(xì)胞與細(xì)胞之間的zui適冷凍速率可在1.6℃～300℃/min，故對一種細(xì)胞進(jìn)行冷凍保存之前，首先需要測定其zui適冷凍速率，以保證獲得zui高的冷凍存活率。