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對于對映異構體的拆分可分為直接法與間接法。直接拆分法是指不經衍生化而直接分離對映體藥物，可以分為手性固定相 (CSP) 法和手性流動相添加劑(CMPA)法。手性固定相法是指將手性選擇劑鍵合到載體上，形成具備手性選擇性的固定相，該法的色譜系統(tǒng)穩(wěn)定性好、方法重現性較好、使用方便，所以應用較為廣泛。
但如果方法開發(fā)時不具備多類別的手性柱，則會限制對手性化合物的拆分。此時則可以考慮CMPA法嘗試拆分。
CMPA法是指在流動相中加入手性選擇劑而在普通色譜柱上分離手性化合物。其優(yōu)點是可采用普通的非手性柱、操作簡便，通過改變CMPA的種類、濃度及流動相組成等多種途徑可優(yōu)化分離條件，但該方法的缺點是其色譜系統(tǒng)穩(wěn)定性較差、平衡時間較長。當進行手性拆分時，結合實際情況，CMPA法也是值得考慮的一種思路。
其作用原理大致可理解為：由于對映異構體R/S的立體構型不同，與手性選擇劑結合的程度不同，所以在兩相分配過程中會出現差異，保留因子k就不會相等，從而實現分離。
環(huán)糊精作為常用的手性添加劑主要分為：α-環(huán)糊精、β-環(huán)糊精、γ-環(huán)糊精及其衍生物類。在手性拆分模型中，環(huán)糊精可大致看作“沒有桶底的水桶"模型，α、β、γ三種類別可看作小桶、中桶、大桶。桶內部呈疏水性，桶上下兩端則是親水性的，化合物的疏水性基團會先進入桶中，親水性基團則會與桶上下兩端通過氫鍵等作用緊密結合，在此過程中，環(huán)糊精與對映異構體R/S結合的程度會出現差異，從而實現分離。
桶中內腔大小與待測物非極性基團的結合程度是對映異構體拆分的關鍵，因此小基團可嘗試α-環(huán)糊精類添加劑、中等基團(苯環(huán)、雜環(huán)等)可嘗試β-環(huán)糊精類添加劑，大基團(如甾體類等)可嘗試γ-環(huán)糊精類添加劑。
除此之外，環(huán)糊精衍生物種類繁多，選擇環(huán)糊精衍生物作為添加劑，不僅會改變杯中內腔的大小，也會提供不同類型的親水基團，從而呈現相對不同的選擇性。
實例：
本待測物質結構中含有氮氧雜環(huán)及氨基基團，經測試，該結構片段大小適合于用β-環(huán)糊精系列拆分。
該待測物極性較大且有堿性基團，故選取封端處理且耐水的C18色譜柱（4.6*250mm，5μm），進行多種環(huán)糊精及其衍生物的篩選，色譜條件如下：
流動相A：20mM乙酸銨緩沖液（pH4.0）+5g待篩選的環(huán)糊精及其衍生物
流動相B：乙腈
A-B（98:2）等度洗脫
流速：0.8mL/min
檢測器：UV
檢測波長：200nm
進樣量：10μL
柱溫：20℃
小小經驗
1
采用環(huán)糊精作為添加劑要有足夠的平衡時間（由于環(huán)糊精這類添加劑溶解后黏度較大，當初次由大比例的水相替換成流動相體系時，基線平衡較緩慢，一般平衡40-60min，后續(xù)每次樣品的后運行就為正常的10-15min左右。）
2
不建議采取大流速，可在0.5mL/min~1.0mL/min。
3
柱溫可明顯改善分離度。
4
環(huán)糊精濃度過大可能會降低拆分效果。
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