 | 重慶市華雅干細(xì)胞技術(shù)有限公司 |
會(huì)員.png)
13
15021010459
當(dāng)前位置：首頁>>技術(shù)中心>>技術(shù)文章>>高品質(zhì)血漿來源cell free DNA NGS文庫構(gòu)建試劑
在線溝通：
顏先生 （經(jīng)理）
- 電話：
- 400-021-2200
- 手機(jī)：
- 15021010459
- 傳真：
- 023-63419626
- 聯(lián)系我時(shí)，
- 告知來自化工儀器網(wǎng)
- 個(gè)性化：
- www.hystemcell.cn
- 商鋪網(wǎng)址：
- http://www.apwanrong.com/st275923/
- 公司網(wǎng)站：
- https://www.ys-bio.cn/
高品質(zhì)血漿來源cell free DNA NGS文庫構(gòu)建試劑
閱讀：1375發(fā)布時(shí)間：2020-11-10
買試劑，找華雅，更多生物試劑，就在華雅思創(chuàng)?。。?/strong>
ThruPLEX® Plasma-seq Kit | ||||||||||||||||||||
| · 專為cfDNA設(shè)計(jì)：經(jīng)過優(yōu)化的修復(fù)及連接試劑 · 高品質(zhì)NGS文庫：在寬廣的GC含量范圍內(nèi)，可以達(dá)到高檢測再現(xiàn)性 · 起始量范圍廣：＜1 ng到30 ng cfDNA量 · 快速簡便：無需純化或樣品轉(zhuǎn)移的單管、2小時(shí)、3步操作步驟 · 應(yīng)用領(lǐng)域：液態(tài)活檢、ctDNA、目標(biāo)區(qū)域測序等領(lǐng)域文庫構(gòu)建 · 兼容自動(dòng)化平臺(tái)：Beckman® FXP Workstation | ||||||||||||||||||||
| ■ 產(chǎn)品說明： | ||||||||||||||||||||
| ThruPLEX® Plasma-seq基于ThruPLEX技術(shù)，并用于血漿來源cfDNA高品質(zhì)NGS文庫構(gòu)建。 該試劑專門針對(duì)cfDNA進(jìn)行優(yōu)化，在保持樣本GC代表性的基礎(chǔ)上，提升了文庫的信息容量。文庫構(gòu)建后可用于CNV分析、全基因組測序分析或是采用一些panel針對(duì)目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行捕獲富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect® and Roche NimbleGen SeqCap® EZ。 血漿樣品采用ThruPLEX Plasma-seq試劑盒制備文庫，能有更好的靈敏度、更準(zhǔn)確的基因變異分析結(jié)果。與其它液態(tài)活檢的樣品一樣，血漿由于其易獲得、價(jià)值高的特點(diǎn)，深受研究腫瘤學(xué)或者孕婦血漿中胎兒游離DNA科研工作者的重視。 | ||||||||||||||||||||
 | ||||||||||||||||||||
| 圖1. ThruPLEX® 技術(shù)概要。ThruPLEX Plasma-seq Kit技術(shù)3步反應(yīng)即可完成針對(duì)cell free DNA的建庫工作。1~30 ng含量的cf DNA首先高效的進(jìn)行末端修復(fù)。通過采用莖環(huán)形接頭（無單鏈尾巴）進(jìn)行高效平端連接，降低了背景。封閉的5’端阻止了接頭-接頭二聚體形成。隨后未使用的接頭被降解，進(jìn)一步降低背景。高保真度擴(kuò)增的方式完成以上反應(yīng)，并獲得含有illumina index的文庫。 | ||||||||||||||||||||
| （*圖片來源于Takara Bio USA,Inc.） | ||||||||||||||||||||
 | ||||||||||||||||||||
| 圖2. 高cfDNA文庫多樣性、更少的Unmapped Reads。ThruPLEX Plasma-seq Kit構(gòu)建的文庫，具有高的多樣性和低的duplicates和unmapped reads。圖中表示cfDNA分別提取于3份血漿樣品，文庫定量采用Qubit熒光定量。Bioanalyzer測定mononucleosomal DNA在各樣品的量分別為0.09 ng、0.62 ng、15.44 ng。Pooled libraries采用illumina NextSeq 500 paired end模式測序，且每個(gè)文庫產(chǎn)生17 M到25 M reads。每個(gè)文庫在down-sampling數(shù)據(jù)至17 M reads以后，計(jì)算Duplication rates。 | ||||||||||||||||||||
| （*圖片來源于Takara Bio USA,Inc.） | ||||||||||||||||||||
 | ||||||||||||||||||||
| 圖3. 優(yōu)異的靶向測序文庫構(gòu)建能力。圖中所示ThruPLEX Plasma-seq Kit構(gòu)建的文庫通過panel進(jìn)行高效捕獲，對(duì)kinome進(jìn)行深度測序分析以檢測突變。3個(gè)血漿樣品分別起始建庫量為5 ng、6.5 ng、10 ng，三次重復(fù)。目標(biāo)區(qū)域采用SureSelectXT2的ClearSeq Human DNA Kinome Panel進(jìn)行捕獲，并用Illumina Miseq平臺(tái)進(jìn)行測序，平均每個(gè)文庫獲得5 M reads，目標(biāo)堿基被成功捕獲分析。 | ||||||||||||||||||||
| （*圖片來源于Takara Bio USA,Inc.） | ||||||||||||||||||||
 | ||||||||||||||||||||
| 圖4. 高重復(fù)性的、無偏倚的GC覆蓋度。針對(duì)人類基因組，ThruPLEX Plasma-seq Kit表現(xiàn)出高再現(xiàn)性、低偏倚GC覆蓋度NGS文庫構(gòu)建能力。9次獨(dú)立的血漿樣品文庫構(gòu)建的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，ThruPLEX重復(fù)性高于其它產(chǎn)品。文庫的制備是利用的1 mL血漿來源cfDNA，后續(xù)采用illumina NextSeq 500進(jìn)行測序。作為對(duì)比，A公司試劑構(gòu)建了4份獨(dú)立血漿樣品的文庫。 | ||||||||||||||||||||
| （*圖片來源于Takara Bio USA,Inc.） | ||||||||||||||||||||
 | ||||||||||||||||||||
圖5. Karolinska協(xié)會(huì)和CRUK測試的結(jié)果。5 ng游離cf DNA采用ThruPLEX Plasma seq Kit進(jìn)行illumina文庫構(gòu)建。結(jié)果表明利用Hiseq平臺(tái)進(jìn)行的Low-pass WGS,每個(gè)文庫能獲得接近12.5 M reads。 訂購信息：
|
更多TAKARA授權(quán)產(chǎn)品，歡迎咨詢，關(guān)注公眾號(hào)：華雅思創(chuàng)生物！
重慶市華雅干細(xì)胞技術(shù)有限公司主營產(chǎn)品：Lonza支原體檢測試劑盒,Stemcell胚胎干細(xì)胞培養(yǎng)基,StemRD生長分化因子
化工儀器網(wǎng) 設(shè)計(jì)制作，未經(jīng)允許翻錄必究.Copyright(C) http://www.apwanrong.com, All rights reserved.
以上信息由企業(yè)自行提供，信息內(nèi)容的真實(shí)性、準(zhǔn)確性和合法性由相關(guān)企業(yè)負(fù)責(zé)，化工儀器網(wǎng)對(duì)此不承擔(dān)任何保證責(zé)任。 溫馨提示：為規(guī)避購買風(fēng)險(xiǎn)，建議您在購買產(chǎn)品前務(wù)必確認(rèn)供應(yīng)商資質(zhì)及產(chǎn)品質(zhì)量。