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當(dāng)前位置：上海起發(fā)實(shí)驗(yàn)試劑有限公司>>技術(shù)文章>>Arraystar AS-NR-004說明書
Arraystar致力于幫助生物醫(yī)學(xué)科學(xué)研究人員了解監(jiān)管非編碼RNA（ncRNAs），這已成為21世紀(jì)生物醫(yī)學(xué)研究中吸引力和挑戰(zhàn)性的方面之一。這些非編碼RNA類包括lncRNA，環(huán)狀RNA，微小RNA，tRNA，tRF，tiRNA，snoRNA等。自2009年成立以來，我們在ncRNA研究領(lǐng)域的創(chuàng)新產(chǎn)品，深入的實(shí)驗(yàn)專業(yè)知識和強(qiáng)大的生物信息學(xué)支持了數(shù)百種高影響力的出版物。多年來，我們的客戶群已擴(kuò)展到數(shù)千個研究機(jī)構(gòu)。
超越RNA
隨著新型非編碼RNA的發(fā)現(xiàn)及其超出蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本的調(diào)控活性，RNA生物學(xué)領(lǐng)域的研究意味著超越編碼信使RNA，這是中心法則的重點(diǎn)。揭示新型ncRNA的關(guān)鍵作用的追求引起了強(qiáng)烈的科學(xué)興趣，具有發(fā)現(xiàn)新的疾病調(diào)節(jié)劑，新的生物標(biāo)志物和治療靶標(biāo)的誘人機(jī)會。雖然基因表達(dá)分析行業(yè)仍主要僅涵蓋mRNA，但Arraystar正在邁向新的道路并向前邁進(jìn)。
焦點(diǎn)
除了傳統(tǒng)的mRNA表達(dá)分析之外，Arraystar的愿景還集中在長和小的非編碼RNA類的轉(zhuǎn)錄組范圍分析，每個類具有不同的RNA特性和生物活性，需要更專業(yè)的方法和生物信息學(xué)來分析：
•lncRNAs
•環(huán)狀RNAs
•tRNAs
•tRFs和tiRNAs
•snoRNAs
•microRNAs及其靶mRNA
•piRNAs
Product Name | Catalog No | Size |
nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array | AS-NR-004-1 | 384-well/ plate |
nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480) | AS-NR-004-1-R | 384-well/ plate |
nrStar™ Mouse Functional LncRNA PCR Array | AS-NR-004M-1 | 384-well (2*192) / plate |
nrStar™ Mouse Functional LncRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480) | AS-NR-004M-1-R | 384-well (2*192) / plate |
nrStar™功能性LncRNA PCR陣列概況372人/ 185小鼠金標(biāo)準(zhǔn)lncRNA具有已知的生物學(xué)功能或疾病關(guān)聯(lián)。它為研究人員提供了一種簡單，準(zhǔn)確且數(shù)據(jù)豐富的交鑰匙解決方案，可用于探索LncRNA功能及其生物標(biāo)記潛力。•
全面收集以生物功能或疾病關(guān)聯(lián)為特征的*的LncRNA。
•功能和疾病LncRNA經(jīng)過仔細(xì)分類，注釋和交叉引用。
•所有引物組均在多種樣品類型中經(jīng)過*驗(yàn)證，以滿足生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)的需要。
•轉(zhuǎn)錄物特異性PCR引物能夠明確，準(zhǔn)確地檢測每種單獨(dú)的LncRNA同種型。
我們建議在運(yùn)行nrStar™功能性LncRNA PCR陣列時使用我們的rtStar™First-Strand cDNA合成試劑盒 （AS-FS-001）和ArraystarSYBR®GreenReal-time qPCR Master Mix，以獲得*性能。
•已知功能性lncRNA的*覆蓋范圍： 從的公共數(shù)據(jù)庫和具有里程碑意義的出版物中全面收集以生物功能或人類疾病關(guān)聯(lián)為特征的*的LncRNA。
圖1.從Bartonicek等人收集了一些與癌癥相關(guān)的lncRNA。2016年
圖2.從Devaux等人收集的一些涉及心臟通路的LncRNA。2015年
•綜合注釋： 與癌癥，心血管疾病和神經(jīng)退行性疾病等疾病相關(guān)的LncRNA經(jīng)過仔細(xì)分類，注釋和交叉引用。
表格1。注釋信息包括：
基于基因組位置的類：[增強(qiáng)子，反義，基因間，內(nèi)含子，雙向...]
靶mRNA基因
機(jī)制：[信號，誘餌，支架，指導(dǎo)，ceRNA，miRNA海綿，剪接...]
生物功能：[細(xì)胞周期，分化，甲基化，免疫，代謝...]
疾?。篬癌癥，心血管，神經(jīng)退行性疾病，腎臟，糖尿病，綜合征...]
注釋實(shí)施例1-癌癥相關(guān)的lncRNA NBAT-1
圖3.由Arraystar注釋的NBAT-1的信息顯示在綠色矩形區(qū)域中。
注釋實(shí)施例2 - 心血管疾病中的LncRNA Mhrt
圖4.由Arraystar注釋的MHRT信息顯示在藍(lán)色矩形區(qū)域中。
注釋實(shí)施例3-LncRNA BACE1-AS在神經(jīng)變性疾病中的應(yīng)用
圖5.由Arraystar注釋的BACE1-AS的信息顯示在紅色矩形區(qū)域中。
•用于生物標(biāo)記物篩選和驗(yàn)證的強(qiáng)大工具： 所有引物組均經(jīng)過優(yōu)化，并使用多種樣品類型進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證，以滿足生物標(biāo)記物發(fā)現(xiàn)的需要。
圖6. PCR陣列上的lncRNA片段，具有公布的生物標(biāo)記電位和效用。
•轉(zhuǎn)錄物特異性檢測： 轉(zhuǎn)錄物特異性PCR引物設(shè)計(jì)用于靶向特定外顯子或剪接點(diǎn)位點(diǎn)，以明確和準(zhǔn)確地檢測每種單獨(dú)的LncRNA同種型。
•zui可靠和準(zhǔn)確的定量： 通過使用外部對照（RNA Spike-In和陽性PCR對照），基因組DNA對照和六個內(nèi)部管家基因，每個lncRNA以高準(zhǔn)確度和數(shù)據(jù)質(zhì)量進(jìn)行定量。通過經(jīng)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的算法選擇的多個參考基因的幾何平均值而不是單個參考基因進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。
•快速簡便： 即用型PCR陣列，采用384孔板格式。整個過程可在不到4小時內(nèi)完成。
工作流程：
圖1. nrStar™功能性LncRNA PCR陣列的工作流程
兼容的qPCR儀器：
ABI ViiA™7
ABI 7500和ABI 7500 FAST
ABI 7900HT
ABI QuantStudio™6 Flex實(shí)時PCR系統(tǒng)
ABI QuantStudio™7 Flex實(shí)時PCR系統(tǒng)
ABI QuantStudio™12K Flex實(shí)時PCR系統(tǒng)
Bio-Rad CFX384
Bio-Rad iCycler ＆iQ實(shí)時PCR系統(tǒng)
Eppendorf Realplex
QIAGEN轉(zhuǎn)子基因Q 100
Roche LightCycler 480
Stratagene Mx3000
Roche LightCycler 480
Arraystar 2018年產(chǎn)品列表
貨號 | 品名 | 規(guī)格 | 品牌 |
AS-FS-005 | rtStar™ tRF&tiRNA Pretreatment Kit | 12 reactions | arraystar |
AS-NR-004-1 | nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array | 384-well/ plate | arraystar |
AS-NR-004-1-R | nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480) | 384-well/ plate | arraystar |
AS-NR-004M-1 | nrStar™ Mouse Functional LncRNA PCR Array | 384-well (2*192) / plate | arraystar |
AS-NR-004M-1-R | nrStar™ Mouse Functional LncRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480) | 384-well (2*192) / plate | arraystar |
AS-NM-001-1 | NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array | 384 (4x96)-well plate | arraystar |
AS-NM-001-1-R | NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array (Roche Light Cycler 480) | 384 (4x96)-well plate | arraystar |
AS-NM-002-1 | NuRNA™ Human Small RNA Biogenesis Proteins PCR Array | 384-well (2*192) / plate | arraystar |
AS-NM-002-1-R | NuRNA™ Human Small RNA Biogenesis Proteins PCR Array (Roche Light Cycler 480) | 384-well (2*192) / plate | arraystar |
AS-NM-003-1 | NuRNA™ Human Epitranscriptomics PCR Array | 384 (4x96)-well plate | arraystar |
AS-NM-003-1-R | NuRNA™ Human Epitranscriptomics PCR Array (Roche Light Cycler 480) | 384 (4x96)-well plate | arraystar |
AS-NM-004-1 | NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array | 384-well plate | arraystar |
AS-NM-004-1-R | NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array (Roche Light Cycler 480) | 384-well plate | arraystar |
AS-NR-001H-1 | nrStar™ Human tRNA PCR Array V2.0 | 384-well (2*192) / plate | arraystar |
AS-NR-001H-1-R | nrStar™ Human tRNA PCR Array V2.0 (Roche Light Cycler 480) | 384-well (2*192) / plate | arraystar |
AS-NR-001M-1 | nrStar™ Mouse tRNA PCR Array | 384-well (2*192) / plate | arraystar |
AS-NR-001M-1-R | nrStar™ Mouse tRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480) | 384-well (2*192) / plate | arraystar |
AS-NR-001-1 | nrStar™ Human tRNA PCR Array V1.0 | 384-well (4*96) / plate | arraystar |
AS-MB-001 | Seq-Star™ rRNA Removal Kit | Human/Mouse/Rat NGS RNA-Seq library preparation | arraystar |
AS-MB-006-01 | Seq-Star™ poly(A) mRNA Isolation Kit | 24 reactions | arraystar |
AS-MB-006-02 | Seq-Star™ poly(A) mRNA Isolation Kit | 96 reactions | arraystar |
AS-MB-009 | Seq-Star™ RNAClean and smallEnrich Beads | 10mL | arraystar |
AS-MB-009 | Seq-Star™ RNAClean and smallEnrich Beads | 10mL | arraystar |
AS-MB-007 | Seq-Star™ DNAClean Beads | 50mL | arraystar |
AS-MB-008-01 | Seq-Star™ DNA Size Selection Kit | 24 reactions | arraystar |
AS-MB-008-02 | Seq-Star™ DNA Size Selection Kit | 96 reactions | arraystar |
AS-MB-010-01 | Seq-Star™ Rapid DNA-seq Kit (Illumina, SetA) | Adapter Barcode(1-12) | arraystar |
AS-MB-010-02 | Seq-Star™ Rapid DNA-seq Kit (Illumina, SetB) | Adapter Barcode(13-24) | arraystar |
AS-MB-012-01 | Seq-Star™ Small RNA-seq Kit (Illumina, setA) | Adapter Barcode(1-12) | arraystar |
AS-MB-012-02 | Seq-Star™ Small RNA-seq Kit (Illumina, setB) | Adapter Barcode(13-24) | arraystar |
AS-MB-013-01 | Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Kit (Illumina, setA) | 24 reactions | arraystar |
AS-MB-013-02 | Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Kit (Illumina, setB) | 24 reactions | arraystar |
AS-PACK-001-A | Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Library Prep Package A – Illumina | 12 reactions | arraystar |
AS-PACK-001-B | Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Library Prep Package B – Illumina | 12 reactions | arraystar |
AS-MR-005-5 | Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX-), 5mL | 5mL | arraystar |
AS-MR-005-25 | Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX-), 25mL | 25mL | arraystar |
AS-MR-006-5 | Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX+), 5mL | 5mL | arraystar |
AS-MR-006-25 | Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX+), 25mL | 25mL | arraystar |
AS-FS-001 | rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit | 12 reactions | arraystar |
AS-FS-002 | rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ adaptor) | 12 reactions | arraystar |
AS-FS-003 | rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ and 5’ adaptor) | 6 reactions | arraystar |
AS-FS-003-02 | rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ and 5’ adaptor) | 12 reactions | arraystar |
AS-FS-004 | rtStar™ tRNA-optimized First-Strand cDNA Synthesis Kit | 12 reactions | arraystar |
AS-FS-005 | rtStar™ tRF&tiRNA Pretreatment Kit | 12 reactions | arraystar |
AS-NR-002-1-M | rtStar™ Pre-designed Human tRF&tiRNA Primer Sets | 100 reactions | arraystar |
AS-NR-001-1-M | rtStar™ Pre-designed Human tRNA Primer Sets | 100 reactions | arraystar |
AS-NR-001M-1-M | rtStar™ Pre-designed Mouse tRNA Primer Sets | 100 reactions | arraystar |
AS-NR-004-1-M | rtStar™ Pre-designed Human Functional LncRNA Primer Sets | 100 reactions | arraystar |
AS-NR-002-1 | nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR Array | 384-well(2*192) / plate | arraystar |
AS-NR-002-1-R | nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480) | 384-well (2*192) / plate | arraystar |
AS-NR-002M-1 | nrStar™ Mouse tRF PCR Array | 384-well (4*96) / plate | arraystar |
AS-NR-002M-1-R | nrStar™ Mouse tRF PCR Array (Roche Light Cycler 480) | 384-well (4*96) / plate | arraystar |
AS-NR-003-1 | nrStar™ Human snoRNA PCR Array | 384 well / plate | arraystar |
AS-NR-003-1-R | nrStar™ Human snoRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480) | 384 well / plate | arraystar |
上海起發(fā)實(shí)驗(yàn)試劑有限公司是實(shí)驗(yàn)試劑一站式采購服務(wù)商
1：強(qiáng)大的進(jìn)口輻射能力，血清、抗體、耗材、大部分限制進(jìn)口品等。
2：產(chǎn)品種類齊全，經(jīng)營超過700多個品牌，基本涵蓋所有生物實(shí)驗(yàn)試劑耗材。
3：提供加急服務(wù)，貨品一般1-2周到貨。
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5：多年積累良好的信譽(yù)，大部分客戶提供貨到付款服務(wù)?？蛻舭ㄇ迦A、北大、交大、復(fù)旦、中山等100多所高校，ROCHE，阿斯利康、國藥、fisher等藥企。
6：我們還是Santa,Advanced Biotechnologies Inc,Athens Research & Technology,bangs,BBInternational,crystalchem,dianova,FD Neurotechnologies,Inc. FormuMax Scientific,Inc, Genebridege, Glycotope Biotechnology GmbH; iduron,Innovative Research of America, Ludger, neuroprobe,omicronbio, Polysciences,prospecbi, QA-BIO,quickzyme,RESEARCH DIETS,INC,sterlitech；sysy,TriLink BioTechnologies,Inc；worthington-biochem,zyagen等幾十家國外公司授權(quán)代理。
7：我們還是invitrogen,qiagen,MiraiBioam,sigma;neb,roche,merck, rnd,BD, GE,pierce,BioLegend等*批發(fā)，歡迎合作。
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