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在抗生素與細(xì)菌長(zhǎng)達(dá) 70 余年的對(duì)抗中,日益嚴(yán)峻的抗菌素耐藥性問題正推動(dòng)科研走向縱深。最新研究發(fā)現(xiàn),細(xì)菌釋放的揮發(fā)性有機(jī)化合物(VOCs)——這些由代謝活動(dòng)生成的“分子指紋",為精準(zhǔn)識(shí)別菌種、破解耐藥機(jī)制提供了關(guān)鍵線索!Longshorewell Institute 研究團(tuán)隊(duì)通過vAPCI-CMS 質(zhì)譜聯(lián)用方案,成功捕獲細(xì)菌代謝釋放的揮發(fā)性有機(jī)物(VOCs),僅需 24 小時(shí)即可 100% 區(qū)分大腸桿菌與金黃色葡萄球菌,2 小時(shí)即顯示部分區(qū)分能力!
技術(shù)亮點(diǎn)
快速檢測(cè):僅需2分鐘完成樣本分析
高靈敏度:區(qū)分大腸桿菌(E.coli)與金黃色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)
實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè):非破壞性采樣,支持長(zhǎng)時(shí)間動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè),追蹤細(xì)菌生長(zhǎng)過程中的VOC變化
實(shí)驗(yàn)成果
24小時(shí)內(nèi)實(shí)現(xiàn)100%靈敏度與特異性區(qū)分;
僅需2小時(shí)即可部分區(qū)分細(xì)菌種類;
通過代謝組學(xué)分析,揭示細(xì)菌生長(zhǎng)與VOC釋放的動(dòng)態(tài)關(guān)系。
實(shí)驗(yàn)方法
細(xì)菌平板制備流程
采用OD600值在0.2-0.5 AU(吸光度單位)的液體培養(yǎng)基菌液,制備細(xì)菌平板(見圖1)。所有接種平板均以一式三份制備,接種后置于37°C恒溫箱培養(yǎng),確保數(shù)據(jù)可重復(fù)性。同步制備三組空白瓊脂平板,與接種平板共同培養(yǎng),精準(zhǔn)排除培養(yǎng)基背景干擾。
圖 1:(A) 大腸桿菌培養(yǎng)的瓊脂平板;(B) 金黃色葡萄球菌培養(yǎng)的瓊脂平板;以及兩者同時(shí)生長(zhǎng)的平板。
vAPCI-MS細(xì)菌VOCs分析全流程
儀器配置:
采用 AIS expression CMS 質(zhì)譜儀,搭載 vAPCI 離子源(圖2)
圖 2:vAPCI-CMS,用于采集揮發(fā)性有機(jī)化合物。
定制化平板采樣器(圖3)恒溫 37°C,與 100°C 加熱傳輸線直連。
圖 3:為 90mm 瓊脂平板設(shè)計(jì)的定制 VOC 采樣器,直接連接到 vAPCI
核心參數(shù):
離子源氣體溫度:350°C;
毛細(xì)管溫度:250°C;
傳輸線溫度:100°C;
動(dòng)態(tài)采樣傳輸線流速:600 mL/min;
質(zhì)荷比范圍:m/z 30-300;
單次掃描時(shí)間:400毫秒;
接種后2/6/24/48/72/96小時(shí)取樣,單次分析僅需2分鐘對(duì)大腸桿菌進(jìn)行24小時(shí)不間斷采樣,動(dòng)態(tài)捕捉VOCs代謝指紋演變。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果
細(xì)菌VOCs的檢測(cè)
每個(gè)樣本通過 150 次質(zhì)譜掃描疊加,生成高信噪比特征光譜。圖 4 顯示了空白瓊脂板和接種 24 小時(shí)的大腸桿菌平板,差異峰直觀呈現(xiàn)菌株特異性代謝指紋。
圖 4:空白瓊脂平板(左)和接種 24 小時(shí)后的大腸桿菌平板的光譜
細(xì)菌VOC特征的區(qū)分
使用 SIMCA 軟件包(Umetrics,版本 14.1)進(jìn)行多變量分析。利用從 m/z 30 到 300 的每個(gè) m/z 響應(yīng)生成統(tǒng)計(jì)模型,分別使用偏最小二乘判別分析(PLS-DA)和主成分分析(PCA)。對(duì)空白、大腸桿菌和金黃色葡萄球菌在 2 至 96 小時(shí)的每個(gè)時(shí)間點(diǎn)的聚類進(jìn)行了評(píng)估。24 小時(shí)后空白組/大腸桿菌/金葡菌實(shí)現(xiàn) 100% 敏感度&特異性分離。在 2 小時(shí)時(shí)觀察到部分分離,金黃色葡萄球菌的靈敏度為 100%,特異性為 91.3%,而大腸桿菌的靈敏度為 87.5%,特異性為 73.9%(圖 5),提示代謝指紋在菌種潛伏期已具差異性!
圖 5:接種后 2 小時(shí)(左)和 48 小時(shí)(右)的空白瓊脂、大腸桿菌和金黃色葡萄球菌的 PCA 分析得分圖
細(xì)菌生長(zhǎng)動(dòng)態(tài)追蹤
大腸桿菌是一種產(chǎn)生吲哚(m/z 118)的細(xì)菌,這是大腸桿菌光譜中的主要離子。通過在 24 小時(shí)內(nèi)監(jiān)測(cè) m/z 118 的變化,可以確定大腸桿菌的生長(zhǎng)曲線(圖 6)
圖 6:連續(xù) 24 小時(shí)監(jiān)測(cè)吲哚(m/z 118)的大腸桿菌生長(zhǎng)曲線
多菌株同步檢測(cè)
基于多變量分析(MVA)篩選的特征標(biāo)記物,可以實(shí)現(xiàn)大腸桿菌(E.coli)與金黃色葡萄球菌(S.aureus)的同步精準(zhǔn)鑒別。圖7展示混合菌株的特征質(zhì)譜峰疊加圖譜。
圖 7:金黃色葡萄球菌(A)和單一平板上同時(shí)存在金黃色葡萄球菌和大腸桿菌(B)的譜圖
總結(jié)
基于 vAPCI 離子源與 AIS expression 質(zhì)譜儀的聯(lián)用技術(shù),體外細(xì)菌培養(yǎng)物揮發(fā)性有機(jī)物(VOCs)檢測(cè)方案已通過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。該技術(shù)具備以下核心優(yōu)勢(shì):
非破壞性采樣
支持對(duì)細(xì)菌代謝特征的長(zhǎng)期動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè),避免樣本損耗,適用于連續(xù)培養(yǎng)研究
智能菌株鑒別
24小時(shí)實(shí)現(xiàn)菌株100%精準(zhǔn)區(qū)分(靈敏度與特異性雙達(dá)標(biāo));
2小時(shí)早期預(yù)警:部分菌株(如金黃色葡萄球菌)鑒別準(zhǔn)確率超91%
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