配方施肥不僅直接表現(xiàn)在農(nóng)作物增產(chǎn)效應上，還體現(xiàn)在培肥土壤，提高土壤肥力方面。平衡施肥結果，土壤養(yǎng)分降礙因子得以消除也是培肥標志之一。全國策二次土壤普查發(fā)現(xiàn)，遼寧省法庫縣大部分農(nóng)田土壤有效磷低于5mg/kg，農(nóng)作物產(chǎn)量始終徘徊在260-300公斤/畝之間。配方施肥技術推行以底全縣化肥N:P2O5保持在1:0.5。多年實施結戰(zhàn)農(nóng)出土壤有效磷普遍恢復到1.5mg/kg左右，農(nóng)作物產(chǎn)量水平也很快提高。沈陽市新城于區(qū)大辛二村4000畝農(nóng)田，連續(xù)10年豎持有機肥、化肥配合施用，化肥抓配方，農(nóng)肥抓秸稈直接還田和城糞，土壤有機質從1.6%提高到2.10％，土壤肥力提高很快。1980年前該村每年施用標準化肥360噸，玉米單產(chǎn)不越過500公斤，現(xiàn)在減少到每年施用化肥70噸，節(jié)省化肥投資18.7刀元，而玉米單產(chǎn)突破的600公斤。  河南省博愛縣界溝鄉(xiāng)連續(xù)五午施行配方施肥，全鄉(xiāng)土壤肥力有明顯提高，有機質增加0.21%，堿解氮增加1.4mg/kg，有效磷增加5.2mg/kg，有效鉀增加1.8mg/kg，土壤理化性狀得到改善。
      利用土壤養(yǎng)分速測儀進行配方施肥中，不論采取肥料效應函數(shù)法還是采取測土施肥法或養(yǎng)分平衡法，都足以確保實現(xiàn)農(nóng)作物一定的目標產(chǎn)量決定施肥量施于土壤，一韶分供應農(nóng)作物營養(yǎng)需要，一部分殘留于土壤，使被農(nóng)作物吸出的養(yǎng)分多于補做而且還有多余。以磷肥為例，20％被農(nóng)作物吸收，80％殘留，肯定會使土壤有效磷和全磷逐漸提高。氮肥是很活潑的營養(yǎng)元荔40％被農(nóng)作物吸收利用，25％殘留，35％損失，其殘留部分似不能補償農(nóng)作物攜出的印分，但可在施用有機肥料的情況下得以解決。有機肥紀的利用率20％，余下大部分以有機態(tài)殘留。由此也可得到啟示，要提高土壤氮素肥力，必須以提高土壤有機質含量為前提，由此可知，配方施肥不僅能帶來明顯的經(jīng)濟效益，而且還可提高土壤肥力，寓生態(tài)效益于其中。