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            徠卡顯微系統(tǒng)(上海)貿(mào)易...

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            直播回顧|復(fù)雜樣品智能識(shí)別及自定義處理工作流

            閱讀:963      發(fā)布時(shí)間:2022-9-9
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            新增功能!
            Aivia 11
            AI 加速分析
             
             

            深度學(xué)習(xí)分割目標(biāo)
             
            多孔板實(shí)驗(yàn)
             
            工作流
             
            集成 Cellpose 的 AI 功能,實(shí)現(xiàn)穩(wěn)健且可重復(fù)的物體檢測(cè)
             
             
             
             
            在Aivia 中探索和分析整個(gè)實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù),并導(dǎo)出到CytoMAP進(jìn)一步分析結(jié)果結(jié)合Aivia的AI工具和訣竅,定制您的專屬圖像分析工作流程,以實(shí)現(xiàn)高效的批量圖像分析
            細(xì)胞計(jì)數(shù),定位,分類的定性與定量
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            大批量數(shù)據(jù)的分析與組間比較
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            深度學(xué)習(xí)分割目標(biāo)
            基于 Cellpose 的物體檢測(cè)
             
                Aivia 11結(jié)合了先進(jìn)的Cellpose(Stringer,2021)[1]——用于目標(biāo)檢測(cè)的深度學(xué)習(xí)模型。我們提供四種新的Cellpose 分析訣竅為所有人提供基于AI 的2D和3D對(duì)象分割,使用者無(wú)需具備Python 編程知識(shí)或訓(xùn)練深度學(xué)習(xí)模型。
               這些模型高度契合各種成像方式和染色條件。無(wú)論您的成像實(shí)驗(yàn)涉及DIC系統(tǒng)還是熒光膜染色,基于Cellpose 的目標(biāo)分割訣竅每次都能夠使您能獲得穩(wěn)健且可重復(fù)的分割結(jié)果。

            • 使用 Cellpose 強(qiáng)大的目標(biāo)檢測(cè)深度學(xué)習(xí)模型

            • 無(wú)需 Python 腳本或深度學(xué)習(xí)模型訓(xùn)練知識(shí)

            • 利用現(xiàn)有的 Aivia 工具進(jìn)行日常分析

            Aivia 9起,我們通過(guò)Python 腳本提供了Cellpose ——AI目標(biāo)分割插件。如今我們將Cellpose集成到現(xiàn)有的分析框架中,Aivia 11工作流程中的深度學(xué)習(xí)細(xì)胞分割變得更加簡(jiǎn)潔高效。

            [1] Stringer C, Wang T, Michaelos M, Pachitariu M. Cellpose: a generalist algorithm for cellular segmentation. Nature Methods. 18: 100-106. (2021)

            媒體庫(kù)

            多孔板實(shí)驗(yàn)
             分析整個(gè)實(shí)驗(yàn)
                    當(dāng)您的實(shí)驗(yàn)同時(shí)具有多個(gè)測(cè)試條件時(shí),您的分析軟件應(yīng)該能夠一次分析所有條件。在Aivia 11中,我們引入的幾個(gè)功能,使您可以在同一平臺(tái)中展示、探索和分析多孔板實(shí)驗(yàn),以快速獲得洞見(jiàn)。 
                從成像實(shí)驗(yàn)開(kāi)始,Aivia 11的新界面Experiment Explorer允許您將徠卡多孔板數(shù)據(jù)導(dǎo)入Aivia。您可以瀏覽來(lái)自單個(gè)孔的圖像或來(lái)自Multi-well Navigator的成像結(jié)果,并使用標(biāo)簽來(lái)注釋板中每個(gè)孔的實(shí)驗(yàn)條件。
             

            • 使用直觀的導(dǎo)航界面導(dǎo)入和探索整個(gè)多孔實(shí)驗(yàn)

            • 定義下游分析的實(shí)驗(yàn)條件

            • 將結(jié)果導(dǎo)出到 CytoMAP 以進(jìn)行進(jìn)一步的數(shù)據(jù)探索

            • 支持來(lái)自MICA等成像系統(tǒng)的多孔板數(shù)據(jù)格式

                您可以在單個(gè) FOV 上使用 Aivia 的內(nèi)置工具分析圖像,并使用新的工作流工具(Workflow Processor)設(shè)計(jì)分析流程。然后,將您構(gòu)建的分析流程批量應(yīng)用于整個(gè)成像實(shí)驗(yàn),或用于添加過(guò)注釋條件的特定孔內(nèi)的圖像。
                從批量分析流程中收集的統(tǒng)計(jì)結(jié)果可以導(dǎo)出到CytoMAP(Stoltzfus,2020)[2],進(jìn)行進(jìn)一步的數(shù)據(jù)探索。利用 CytoMAP 的功能(如降維)加速獲取成像實(shí)驗(yàn)中洞見(jiàn),從而加快您的成果發(fā)布過(guò)程。

            [2] Stoltzfus CR, Filipek J, Gern BH, et al. CytoMAP: a spatial analysis toolbox reveals features of myeloid cell organization in lymphoid tissues. Cell reports. 31(3): 107523.

            媒體庫(kù)

            工作流
            完整的分析流程
                我們?yōu)槟峁┝吮纫酝叩淖杂啥取T贏ivia 11中您可以自定義圖像分析流程。Workflow Processor 允許您設(shè)計(jì)“從數(shù)據(jù)導(dǎo)入到目標(biāo)分類和結(jié)果導(dǎo)出"的完整分析流程。
                Workflow Processor 允許您將 Aivia 中的分析工具(圖像增強(qiáng)功能、AI 支持的像素分類器、深度學(xué)習(xí)模型、圖像分析訣竅、測(cè)量結(jié)果和目標(biāo)分類器)整合到同一個(gè)工作流中。此外,您還可以設(shè)置多個(gè)工作流以連續(xù)運(yùn)行,從而擴(kuò)展分析功能。

            • 混合搭配 Aivia 的分析工具,創(chuàng)建您自己的分析流程

            • 可以從頭開(kāi)始設(shè)計(jì)工作流,也可以根據(jù)以前分析的結(jié)果構(gòu)建工作流

            • 批量應(yīng)用自定義工作流,快速獲得結(jié)果

                設(shè)計(jì)工作流的過(guò)程已整合到Aivia 中的分析工具中。“創(chuàng)建工作流(Create a Workflow)"功能可將數(shù)據(jù)分析訣竅中的圖像增強(qiáng)及像素分類器自動(dòng)加載到Workflow Processor 界面中 , 讓您能夠快速創(chuàng)建批處理流程,將分析應(yīng)用于整個(gè)實(shí)驗(yàn)。這樣就無(wú)需回憶您采取的每個(gè)分析步驟,因此您可以專注于結(jié)果的解析。

            媒體庫(kù)

            其他改進(jìn)

            • 3D 細(xì)胞分析和 3D 細(xì)胞姿勢(shì)配方的網(wǎng)格預(yù)覽速度更快

            • 從標(biāo)記的圖像創(chuàng)建 2D 和 3D 對(duì)象

            • AiviaWeb具有存儲(chǔ)和自動(dòng)存檔功能,可作為訂閱選項(xiàng)提供

             
            人工智能不僅僅是一個(gè)流行語(yǔ)
                Aivia為希望從圖像中提取更多信息的顯微鏡學(xué)家和研究人員提供高性能的圖像處理和展示平臺(tái)。Aivia中支持AI的工具簡(jiǎn)化了成像分析的關(guān)鍵步驟,并為用戶提供了針對(duì)其數(shù)據(jù)量身定制的解決方案。
             
            了解Aivia
             
             

            深度學(xué)習(xí)
             
            Teravoxel 3D 渲染
             
            虛擬現(xiàn)實(shí)
             
            神經(jīng)元示蹤
             
            3D 跟蹤
             
            完善的支持
             
            使用先進(jìn) 的AI 工具為數(shù)據(jù)量身打造增強(qiáng)、分割和預(yù)測(cè)工具
             
            實(shí)時(shí)展示數(shù)萬(wàn)億個(gè)體素和數(shù)千個(gè)對(duì)象
             
            在沉浸式環(huán)境中交互探索 3D/4D 數(shù)據(jù)集
             
            使用智能追蹤工具進(jìn)行快速神經(jīng)元重建
             
            分析物體運(yùn)動(dòng)并探索細(xì)胞分裂、分化和命運(yùn)
             
            每個(gè)訂閱計(jì)劃都包含免費(fèi)升級(jí)和技術(shù)支持
             

            了解更多:徠卡顯微

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