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幽門螺桿菌耐藥嚴重 我國發(fā)明藥敏檢驗新方法精準診療
2022年06月24日 09:54:51
來源：化工儀器網(wǎng) 作者：宋池 點擊量：4701
近日，我國科研團隊研發(fā)了一種單個細菌細胞精度、“鑒定-藥敏-溯源”全流程一體化的幽門螺旋菌診療技術(shù)CAST-R-HP。
【化工儀器網(wǎng) 項目成果】近日，中國科學院青島生物能源與過程研究所與中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所、青島市立醫(yī)院、青島星賽生物等組成的聯(lián)合團隊以原創(chuàng)的臨床單細胞拉曼藥敏快檢系統(tǒng)(CAST-R)為基礎(chǔ)，研發(fā)了一種單個細菌細胞精度、“鑒定-藥敏-溯源”全流程一體化的幽門螺旋菌診療技術(shù)CAST-R-HP。成果發(fā)表于《臨床化學》。
幽門螺桿菌(Hp)是一種常見的細菌病原體，主要通過糞-口、口-口、胃-口傳播，與胃炎、消化性潰瘍和胃癌等多種消化道疾病有密切關(guān)系。據(jù)統(tǒng)計，幽門螺桿菌在全球自然人群中的感染率超過50%，同時耐藥嚴重，導(dǎo)致幽門螺桿菌感染難以根除并且容易復(fù)發(fā)。因此，
建立一個高效的藥敏診斷、治療與溯源體系，研究幽門螺桿菌的耐藥性，對于幽門螺桿菌感染的臨床治療與防控意義重大。
目前，幽門螺桿菌耐藥菌鑒定的臨床金標準是內(nèi)鏡檢查與細菌培養(yǎng)相結(jié)合的藥敏檢驗。但是這種方法耗時很長：一方面分離和培養(yǎng)胃活檢標本中的幽門螺桿菌需要7-10天，另一方面獲得純培養(yǎng)后開展的表型藥敏實驗同樣需要大量時間。另外，這種方法在實驗室中進行，無法“原位”對臨床樣品中的病原多樣性進行考察。而且只能預(yù)測部分已知耐藥基因的突變，并存在不同程度的假陰性。因此在臨床治療中藥敏檢驗難以推廣，而僅靠經(jīng)驗指導(dǎo)用藥根除感染的失敗率非常高。
研究團隊通過單細胞拉曼光譜技術(shù)建立了測定代謝抑制程度的幽門螺桿菌藥敏表型快檢技術(shù)CAST-R。團隊首先構(gòu)建了15種臨床常見胃部共生菌的單細胞拉曼光譜(SCRS)參考數(shù)據(jù)庫，再利用端到端的深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)融合拉曼光譜特征提取與分類模型訓練過程以提升病原鑒定準確率。CAST-R可以直接從臨床胃黏膜樣品出發(fā)，識別并鑒定幽門螺桿菌細胞。根據(jù)實驗結(jié)果，該技術(shù)的檢測準確率達98.5±0.27%。
CAST-R還可以用于研究耐藥機制并進行全基因組溯源。從臨床樣品中直接識別特定藥敏表型的幽門螺桿菌細胞，并對其進行拉曼分選和核酸擴增，通過基因型驗證藥敏表型。為幽門螺桿菌耐藥性的研究提供了有效手段。
(資料來源：科技日報)
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